SYNLAB MVZ
Humangenetik Mannheim

Leistungsverzeichnis

panel : ID062.00
Stickler-Syndrom (STL) : 6 Gene (21,987 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
COL2A1 108300 AD Stickler-Syndrom (STL1) SNV und CNV: Short Read NGS
COL2A1 609508 AD Stickler-Syndrom (STL1), atypisch SNV und CNV: Short Read NGS
COL9A1 614134 AR Stickler-Syndrom (STL4) SNV und CNV: Short Read NGS
COL9A2 614284 AR Stickler-Syndrom (STL5) SNV und CNV: Short Read NGS
COL9A3 620022 AR Stickler-Syndrom (STL6) SNV und CNV: Short Read NGS
COL11A1 604841 AD Stickler-Syndrom (STL2) SNV und CNV: Short Read NGS
COL11A2 184640 AR Stickler-Syndrom (STL3) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Stickler-Syndrom (STL)
COL11A1, COL11A2, COL2A1, COL2A1, COL9A1, COL9A2, COL9A3
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
COL11A1, COL11A2, COL2A1, COL9A1, COL9A2, COL9A3
HPO Terms
High myopia, Retinal detachment, Lens subluxation, Sensorineural hearing impairment, Cleft palate, High, narrow palate, Micrognathia, Midface retrusion, Flat face, Joint hypermobility, Early-onset osteoarthritis, Joint pain, Visual impairment, Cataract, Abnormality of the eye, Abnormality of the dentition, Short stature, Abnormal pinna morphology, Nystagmus
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